Statistilise analüüsi meetodid
  • Avaleht
  • Õpiväljundid
  • Õpijuhend
  • Sissejuhatus
  • Hüpoteesid nii ja naa
  • Väheste väärtustega diskreetsed ja nominaalsed tunnused ja faktorid
    • Sagedustabeli analüüs
    • ANOVA (Näide1)
  • Pidev tunnus ja pidev faktor
    • Pidev_tun_test
    • Regressioonanalüüs
    • Aegrea analüüs
  • Pidev tunnus, binaarne või diskreetne faktor
    • T-test
    • ANOVA näiteid
  • Binaarsed tunnused
    • 2 X 2 sagedustabeli analüüs
    • Logistiline mudel 1
  • Üldistatud lineaarne mudel
    • Näide
  • Mitteparameetrilised testid
  • Andmefailid
  • Tagasiside "Analüüsimeetodid"

Fisheri testi vastus

Märkus! R Fisheri test leiab sansside suhte 0 vs 1! Kuigi loogiline oleks vastupidi. Kuna aga jagatis on nagunii pöördvõrdeline, siis on võimalik tulemus lihtsalt pöördväärtust võttes ümber arvutada, alljärgneva näite puhul nii ka teeme. 
cop=as.numeric(I(Cop2>0))
t1=table(cop,Osa);t1

   Osa
cop Lämmijärv Suurjärv
  0         6       15
  1        13        4

fisher.test(t1)
        Fisher's Exact Test for Count Data
data:  t1 
p-value = 0.008138
alternative hypothesis: true odds ratio is not equal to 1 
95 percent confidence interval:
 0.02146905 0.64249844 
sample estimates:
odds ratio 
 0.1313954 


1/0.1313954
[1] 7.610617

Teisendame arvukused 0-1 tunnuseks-kui esineb, siis on väärtus 1.
Sagedustabel, millest silma järgi võib ütelda, et uuritavat liiki tuleb proovianumasse sagedamini  Lämmijärves.
Fisheri test .


Seos on oluline, šansside suhe ei ole 1.

 Cop1 mitteleidumise (vaata märkus ülal) šanss Lämmijärves on 0.1313954 korda suurem kui Suurjärves, mis on üpris kohmakas väide.
Aga kui võtta sellest pöördväärtus (so 7,61) ja ütelda nii, et liigi Cop2 leidumise šanss Lämmijärves on umber 8 korda suurem, on asi arusaadavam. Ka 95% usalduspiirid peab ümber arvutama!

t-testiga

 t.test(Cop2~Osa)
        Welch Two Sample t-test
data:  Cop2 by Osa 
t = 3.4677, df = 20.542, p-value = 0.002358
alternative hypothesis: true difference in means is not equal to 0 
95 percent confidence interval:
 1.850184 7.412974 
sample estimates:
mean in group Lämmijärv  mean in group Suurjärv 
              5.2631579               0.6315789

Lämmijärves proovides on keskmiselt 5,26-0.63=4.63 liigi Cop2 isendit rohkem.

Tagasi                                                                                                                                                         Järgmine teema
Powered by Create your own unique website with customizable templates.