Statistilise analüüsi meetodid
  • Avaleht
  • Õpiväljundid
  • Õpijuhend
  • Sissejuhatus
  • Hüpoteesid nii ja naa
  • Väheste väärtustega diskreetsed ja nominaalsed tunnused ja faktorid
    • Sagedustabeli analüüs
    • ANOVA (Näide1)
  • Pidev tunnus ja pidev faktor
    • Pidev_tun_test
    • Regressioonanalüüs
    • Aegrea analüüs
  • Pidev tunnus, binaarne või diskreetne faktor
    • T-test
    • ANOVA näiteid
  • Binaarsed tunnused
    • 2 X 2 sagedustabeli analüüs
    • Logistiline mudel 1
  • Üldistatud lineaarne mudel
    • Näide
  • Mitteparameetrilised testid
  • Andmefailid
  • Tagasiside "Analüüsimeetodid"

Binaarne tunnus, mistahes tüüpi faktor

Andmed samad, mis Fisheri testi puhul peipsi_zpl.csv, tunnuse Cop2 ehk uuritava liigi arvukuste põhjal teeme jälle binaarse tunnuse, nii et esinemine on 1. Logistilise mudeli korral prognoositakse R programmis 1 šanssi!
Oluline vahe Fisheri testiga on selles, et faktoreid võib olla rohkem ja nad ei pea olema väheste väärtustega
cop=as.numeric(I(Cop2>0))
logist=glm(cop~Osa,family=binomial);summary(logist)
Call:
glm(formula = cop ~ Osa, family = binomial)
Deviance Residuals: 
    Min       1Q   Median       3Q      Max  
-1.5183  -0.6876  -0.6876   0.8712   1.7653  
Coefficients:
                        Estimate       Std. Error z value Pr(>|z|)   
(Intercept)        0.7732         0.4935     1.567  0.11721   
OsaSuurjärv  -2.0949          0.7485   -2.799  0.00513 **
---
AIC: 47.256
> exp(2.0949) 
[1] 8.124628

Andmete teisendamine binaarseks.
Kontrollime alustuseks järve mõju.
glm protseduur võimaldab valida uuritava tunnuse jaotust, binaarse puhul on see binomial.




Suurjärves on Cop5 leidumise  šanss väiksem, logaritmskaalas 2,0949 võrra.
Šansside suhte jaoks peame  kordaja tagasi teisendama, võttes selle eksponenti.
Lõplik vastus on logistilise mudeli põhjal: Cop5 leidumise  šanss Suurjärves on 8 korda väiksem kui Lämmijärves. 
Tulemus peab olema enam-vähem sama, kui Fisheri testi korral oli. 
Järgmine teema
Powered by Create your own unique website with customizable templates.